國家海洋技術中心從1999年開始建立質量管理體系，歷經19年的發展，已經形成了成熟的質量管理體系結構，質量方針和質量目標明確，建立了各部門的質量職責、權限和相互關系，為中心的質量管理活動提供了行動準則。中心質量管理體系民品的覆蓋范圍是：海洋環境調查/觀測/監測/監視技術研究和相關儀器設備及系統的研制和服務；海域面積測繪。質量管理體系認證有力的促進了中心質量管理體系的改進和完善，進一步推進中心自身發展建設和管理創新，全面提升中心項目的管理質量，優化中心項目管理流程，實現項目管理高效化、運行規范化和標準化。